- شخصیت خود ساخته و متواضع
- ارتباط صمیمی با حضرت امام و علاقه امام به ایشان
بعد از رحلت حضرت امام، جمعی از اهالی و علمای آذربایجان در خدمت آیت الله ملکوتی در جماران حضور یافتیم مرحوم سید احمد آقای خمینی برای حاضرین مطالبی را ایراد فرمودند که ضمن سخنانش به حضرت آیت الله ملکوتی اشاره نموده و فرمودند شما علمای محترم و مردم شریف آذربایجان قدر این مرد بزرگ را بدانید ایشان نماینده حضرت امام هستند و از مقربان ایشان بودند و حضرت امام به ایشان علاقه شدیدی داشتند.
- تسلط به کتب اسلامی
یادم هست در آن دوران هر سال در دانشگاه تبریز، کنگره بزرگداشت مقام علمی و عملی حضرت علامه طباطبایی برگزار می شد و حضرات آیات سبحانی، جوادی آملی، مکارم شیرازی، علامه مصباح یزدی وعلامه حسن زاده آملی، در سنوات مختلف در کنگره حضور داشتند در سالی که چند نفر از این بزرگان همزمان حضور داشتند حاج آقای ملکوتی در ضمن سخنرانی سوالی مطرح نمودند خطاب به حضرات اساتید میهمان فرمودند آقایان علماء بفرمایند که چرا قوت و وزانت تفسیر المیزان جناب علامه تا سوره یونس به سیاقی پیش رفته است که بعد از آن اینگونه نبوده و تفاوتهایی به چشم می خورد که حضرات آقای مکارم شیرازی بعد از جلسه جوابی دادند که مورد تایید ایشان نیز بود. قصدم این است که بسیار به محتوای کتب اسلامی تسلط داشتند و از حیث علمی به حق وزانت و جایگاه بسیار عالی داشتند و می توان گفت به معنای حقیقی ملّا بودند.
- مقام فقاهت
در برنامه تودیع و معارفه مسئول دادگستری استان که قرار بود توسط آیت الله محمدی گیلانی در تبریز انجام شود حضرت آقای ملکوتی نیز حضور داشتند بسیار عجیب بود آقای گیلانی که خود یک فقیه و آدم ملّایی بودند در حین توصیه های خود به مسئولین، چنین فرمودند اگر در پرونده ایی به مشکل برخورید به
تحریرالوسیله حضرت امام و یا منهاج الصادقین حضرت آیت الله خوئی (رحمه الله علیهما) مراجعه نمایید اگر جواب را در آنها نیافتید نیازی به مراجعه به جای دیگر نیست خدمت فقیه عالیقدر حضرت آیت الله ملکوتی شرفیاب شوید و هر چه ایشان حکم فرمودند عمل نمایید چرا که مهم این است که حکم صادره با رأی یکی از فقهای اعلام مطابقت داشته باشد. و آن تاییدی بود بر جایگاه فقهی و اجتهادی حضرت آیت الله ملکوتی که به حق شایسته همین بود.
- تکلیف گرا
در همین روزهای تشیع پیکر مطهر حضرت آیت الله ملکوتی که در محضر حضرات آیات جوادی آملی و سبحانی تبریزی بودم سخنان عجیبی در مقام علمی ایشان فرمودند از حضرت آیت الله جوادی شنیدم که فرمودند حضرت آیت الله ملکوتی عالمی بودند جامع معقول و منقول، این سخن از حضرت ایشان در مقام یک عالم نشان از جایگاه علمی والای آن عالم ربانی دارد و خود آیت الله سبحانی نیز فرمودند که بنده حدود ۷۰سال است با ایشان رفاقت و رفت و آمد داریم اگر ایثار نمی کردند و به تبریز نمی رفتند از مراجع بزرگ شیعه بودند.